2013年,已经在莫斯科第一医科大学药学专业取得硕士学位的晏成,放弃了企业和科研单位提供的丰厚待遇,毅然投身到乔治华盛顿大学生物信息学专业进行深造。作为一个知识驱动型和数据密集型的新兴学科,生物信息学融合了生命科学和信息科学,包含了生物信息的获取、加工、存储、分配、分析、解释等在内的所有方面,承载了科学家以此攻克癌症的厚望。 在历经手术、化疗、放疗等治疗方法后,依靠海量的癌症临床数据,根据个体基因组学特征、环境和生活习惯进行干预和治疗成为更具优越性的技术手段。2011年,美国医学界提出了“精准医疗”的概念,简言之就是对症下药,量体裁衣;2015年1月,美国总统奥巴马在国情咨文中提出了“精准医疗”计划。生物信息学的进步,无疑为个性化定制的精准医疗的发展提供了肥沃土壤。 在校期间,癌症基因组学是晏成研究工作的重中之重,他不仅推动了该领域的理论创新进程;还合作完成了FDA、NIH 和MGPC(GWU-FDA)主导的重大科研项目,为泛癌种数据分析平台、设计和建立癌症突变数据库,癌症基因表达数据库和药物基因组学数据库等做出了开创性贡献。期间,晏成先后在国际知名学术刊物Database (Oxford)上发表了论文An integrated RNA-seq-derived gene expression database for pan-cancer analysis、Generating a focused view of disease ontology cancer terms for pan-cancer data integration and analysis,在生物信息学界产生了广阔的影响力。迄今,这两篇论文已产生了数十次的引用量,为同行科学家的研究工作提供了权威参考。 目前,晏成担任泛生子公司(Genetron Health)的生物信息学经理。泛生子是聚焦癌症精准医疗的佼佼者,拥有中美双研发中心,4个医学检验实验室,以及国际上先进、全面、多元的检测平台。在这里,晏成带领生物信息团队同多家医院和科研机构开展了科研合作。比如同NIH合作关于ATRX基因在癌症中的作用的文章Persistence of Skewed X-Chromosome Inactivation in Pre-B Acute Lymphoblastic Leukemia of a Female ATRX Mutation Carrier发表在Blood Advance上。同时晏成团队开展了多项研发项目,包括针对多种肿瘤突变类型的检测机器学习算法的开发。力求最大可能降低假阳性率,进而提高癌症筛查和个体化用药的准确性,避免医疗浪费。 多年的研究汇成令人瞩目的成果,迄今为止,他已经在多个重要期刊上发表了多篇学术论文,这里面不乏Blood Advance, The pharmacogenomics journal、Mol Brain、Sci Rep、Methods Mol Biol、GLYCOBIOLOGY、Comput Biol Med等知名业内期刊,其先进的科研理念得到了业界同仁的关注和学习。 2018年,世界卫生组织公布的最新全球癌症大数据显示,全年世界新增的癌症患者达1810万人,因癌症死亡的人数约960万人。中国新发病例数380.4万例,占据全球癌症新发病人数的20%以上。如此触目惊心的数据令晏成加紧了对生物信息学的探索步伐。在他看来,免疫疗法和液态活检是癌症治疗的未来。在精准医学时代,与癌症作战更讲究“关口前移”,当下的研究将为癌症的早期筛查和高效诊治奠定坚实的基础。(文:张小小)
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